开学典礼在观看院校宣传片《尊科学济人道》中拉开序幕，全体师生通过影片回顾了协和与党同行、与国同心的百年历程，在协和历史的峥嵘与荣光中，体悟协和许国为民的初心使命和改革创新的引领担当。
庄严肃穆的国歌奏唱后，由教务处处长马超教授领誓，全体新生庄严宣誓，“除人类之病痛，助健康之完美……为祖国医药卫生事业的发展和人类身心健康奋斗终身。”铮铮誓言映初心。字字句句均是协和学子心底的声音，编奏成启程追梦的号角。
中国医学科学院院长、学部委员，北京协和医学院校长王辰院士在讲话中，希望同学们在学习期间从“人格、学格、体格”三方面受到锻造，培育出美好的人格、学格、体格，成就圆满事业人生（王辰校长讲话内容将另文发表）。
院校党委书记、副院校长姚建红主持典礼并指出，作为新时代的协和人，我们有责任、有义务去不断挖掘、思考、继承和发扬我们协和精神的内涵，要有胸怀天下的境界、甘于付出的品格。“青年一代有理想、有本领、有担当，国家就有前途，民族就有希望” 。站在协和新百年的历史起点上，让我们充满骄傲、自豪，更怀揣信心和梦想，与新学子们共同出发，谱写协和新百年的璀璨华章。
新生代表2025届博士生李忠臣表示，作为新一代的协和人，将勇敢地担当起发展祖国医学，护佑人民健康的重任；将怀揣家国情怀，传承协和精神，彰显学子风貌，成为有理想、有本领、有温度、有担当的协和人。砥砺前行，接续协和的百年荣光。
整形外科医院院长蒋海越作为教师代表寄语新生，要“乐学善思，笃行致远”，注重“强基”训练，不断守正创新，树立正念思维，具有悲悯之心，以坚毅执着的求索精神，攻坚克难的无畏品质，源源不断的内生动力，担负起“面向人民生命健康”的艰巨使命。
东庭会场
根据疫情防控要求，典礼采取线上线下结合的方式，设置壹号礼堂主会场和35个分会场，院校领导、各培养单位领导、教师代表及2472名新生参加了开学典礼。
